هر مجموعه سیستم پروازی، دارای یک واحد کنترل کننده و فرماندهی می­ باشد، سیستم ­های پروازی بدون سرنشین نیز قطعا از این قاعده مستثنی نیستند. سیستم کنترل پرواز در مولتی روتورها یکی از حیاتی­ ترین بخش ­ها در مولتی روتورها می­ باشد، زمانی که که یک مولتی روتور می­ سازید باید به این نکته توجه داشته باشید که موتورها برای تولید نیروی برخاست عمودی، بایستی به شکل مناسبی بر روی بدنه قرار بگیرند و در این حالت برای ایجاد تعادل هواپیما، نیاز به یک مدیریت حرفه ­ای و قوی می­ باشد، این مدیریت حرفه­ ای در واقع همان سیستم کنترل پرواز می­ باشد که هسته مرکزی مولتی روتور را تشکیل می­ دهد. فلایت کنترل، تنظیم و کنترل پرواز هواپیما با دقت زیاد را برای خلبان را فراهم می­ نماید. در دهه­ های گذشته بدلیل اینکه فلایت کنترل­ ها به شکل امروزی دارای دقت خوبی نبودند، اغلب پرواز هواپیماهای بدون سرنشین با دقت زیاد همراه نبود. اما امروزه بدلیل پیشرفت علم کنترل پرواز الکترونیکی، مشاهده می­ نماییم که این فلایت کنترل­ ها دارای دقت به مراتب بیشتری نسبت به گذشته هستند. فلایت کنترل­ ها از لحاظ دقت فرامین و تعداد جایروها به دو دسته آماتور و حرفه­ ای تقسیم­ بندی می­ شوند که در فلایت کنترل­ های آماتور تعداد جایروها کمتر از ۳ عدد و هزینه فلایت کنترل پایین می ­باشد و از آن ها عموما در هواپیماهای کوچک استفاده می­شود. فلایت کنترل ­های حرفه­ ای دارای تعداد جایروهای بیش از ۳ عدد هستند و عموما دارای دقت پرواز بالایی هستند.

موارد تشکیل دهنده فلایت کنترل:

۱- واحد فرماندهی (main control)

۲- واحد تقسیم ولتاژ و کنترل ماژول­ها (PMU:Power Management Unit)

۳- واحد کنترل اینرسی پرنده (IMU: Inertial Measurement Unit)

۴- ماژول تثبیت ­کننده در یک نقطه (Compass GPS)

۵- ماژول هشداردهنده (LED)